Дудек перешел в роттердамский «Фейеноорд» в 1996 году, после того как провёл лишь 15 встреч в составе клуба из родного города. После ухода Эда Де Гуя в «Челси» Дудек наконец получил свой шанс закрепиться в составе первой команды, которым воспользовался сполна.

 

В сезоне 1998/1999 Ежи был признан лучшим голкипером нидерландского первенства. Наставник «Фейеноорда» Лео Беенхаккер не мог нарадоваться на своего вратаря. «Это лучший кипер, которого я видел за последние 30 лет», — говорил тренер. Дудек оказался на грани перехода в лондонский «Арсенал», однако в конечном счете всё обернулось как нельзя лучше для «Ливерпуля», и Ежи переехал на «Энфилд».

 

Дудек прекрасно провел свой первый сезоне в Англии, однако в сезоне 2002/2003 столкнулся с некоторыми проблемами, временно потеряв своё место в первой команде. Однако после того, как Крис Керклэнд, который вытеснил Ежи из состава, получил травму, Дудек вернулся в ворота команды.

 

Дудек по праву заслужил статус героя «Ливерпуля», проведя фантастический матч в мае 2005 года в Стамбуле. Танцующий преемник Брюса Гроббелара ещё долго будет являться в кошмарных снах звезде «Милана» Шевченко. Дудек не только спас свою команду после двух подряд ударов украинца в упор на последних секундах добавочного времени, но и сумел отразить удар Андрея в серии одиннадцатиметровых ударов. Этот сэйв поляка принес «Ливерпулю» победу в Кубке чемпионов (пятый для скаузеров). После прихода в команду испанца Пепе Рейны, Дудек потерял свое место в «основе». Как бы то ни было «Большой поляк в наших воротах» (big Pole in our goal) сумел навсегда вписать свое имя в историю «Ливерпуля».

 

Убедившись в том, что в «Ливерпуле» ему не светит вновь вернуть место основного вратаря, Дудек подался в Мадрид, где подписал соглашение с местным Королевским клубом. Однако и там Ежи вынужден довольствоваться ролью сменщика основного вратаря, на сей раз Икера Касильяса. Несомненно, оказаться вторым вратарем «Реала» вовсе неплохо, но, если причиной, побудившей поляка покинуть Мерсисайд, было желание быть основным вратарем, то команда была выбрана не самая подходящая.

 

Дудек лишь один раз сыграл в матче испанского чемпионата (в сезоне 2007/2008 против «Сарагосы») и один матч в ЛЧ (против «Зенита»). В конце сезона 2008/2009 появлялись сообщения о том, что Ежи может вернуться в «Фейеноорд», в котором он блистал до «Ливерпуля», или даже в Премьер-лигу, но Дудек остался в «Реале», продлив контракт ещё на год. 21 мая 2011 года в матче против «Альмерии», Ежи провёл свой последний матч за «бланкос». Его заменили на 78 минуте матча, футболисты «Реала» проводили польского голкипера торжественным коридором, а болельщики - стоя овациями.